人体内有数量巨大、种类繁多的微生物，它们共同组成了人体微生态系统。经过漫长的生物进化过程，正常菌群与人体处于共生状态，并与人体建立起密切的关系，对促进人体生理机能的完善尤其是免疫功能的成熟起非常重要的作用。
我们每一个人的消化道、头发、口腔、鼻腔、以及生殖道内，都有着丰富而独特的微生态。其中肠道作为人体的免疫器官，肠道微生态也是人体内最主要且最复杂的微生态系统，占人体总微生物量的68%。
肠道菌约有 500-1000 种以上，除细菌外，人体内还存在正常病毒群、正常真菌群、正常螺旋体群等，这些细菌多达 1000 余种，它们在胎儿出生后 2 小时即进入人体，从此终生相伴直至人体死亡，各种细菌之间、细菌与人体之间和平共处，共同构成人体的微生态平衡。
平衡的微生态系统中，有益菌数量占主导地位，易于形成竞争优势，定植于肠道，抑制有害微生物定植，组织有害微生物进入血液循环系统。肠道菌群分泌各类代谢产物，通过血液循环系统到达人体各个器官，对人体产生影响。
当人体内的微生态处于平衡状态时，人就处于健康状态，而如果由于环境影响，出现外源性感染或者是内源性感染，导致体内微生态失衡，人体就会进入亚健康、甚至是疾病状态。
目前大量文献报道，肠道菌群与多种慢性病包括糖尿病、肥胖、“三高”、心脑血管疾病、慢性肝病、内分泌免疫系统相关疾病、自闭症、抑郁症、精神病、阿尔兹海默病及恶性肿瘤等有关。大量临床研究报道微生态制剂能减轻相关疾病症状。
因此，保护好肠道健康，建立肠道菌群生态平衡至关重要。