很多科技服务机构不愿意辅导初创型的企业申报高企，因为新成立的初创型企业在申报高新技术企业认定过程中，必然会遇到以下几个难以回避的问题：
1、社保
有些初创型企业为了节省费用，往往核心创业人员甚至初创团队的员工都不缴纳社保，将钱省下来用于产品研发、生产、销售。
2、财务
初创型的企业多以技术人才为主，这类企业技术方面比较，但财务管理方面就相对比较松散。互联网支付技术的发展，导致很多企业采用线上收款，直接进入账户，即使进入公司账户也很少开票，导致财务账目混乱，这不但会影响高新技术企业的申报认定，甚至会带来不必要的高额税收和税务风险。