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企鹅是典型的海鸟，它虽然不会飞，但是游泳的本领在鸟类中是超级选手。许多水鸟游泳是靠长有蹼的双脚在水中划动而前进，企鹅的脚虽然也长有蹼，却只用来当做控制方向的舵，前进的力量全靠那双船桨般的翅膀，在水中振翅飞翔。[7]

企鹅游泳的速度非常快，皇帝企鹅一小时可游约十公里，白顶企鹅则有一小时游三十六公里的纪录，是所有鸟类中游得快的。企鹅常常用海豚式游泳，也就是潜泳一段距离，露出水面换气后，再潜下去继续游。事实上，企鹅也是鸟类当中的潜水，它曾有潜入水中18分钟，和潜入水下265米的纪录。[7]

通过观察与企鹅紧密相关的海鸟，科学家们确定，适合于飞行的翅膀并不适合潜水和游泳。长期以来都有几个理论解释为什么企鹅无法飞行。一个观点认为，一些物种是因为缺乏地面的捕食者而失去了飞行能力。另一个观点是一种生物力学假设：当鸟类飞行和潜水的时候，它必须使用翅膀进行两种不同的工作。从生物力学假设，无法打造出同时擅长这两种工作的翅膀。

企鹅曾经面临一种进化选择，是选择在空中飞行还是选择在水下灵活游动。通常随着翅膀在企鹅潜水时变得越来越，它们的飞行能力就变得越来越弱。在某一时刻，飞行就变得非常费力，因此的选择就是放弃飞行，而且让翅膀缩小成为鳍状肢。