运输过程中产生二次污染。吸粪车的滴洒泄漏使臭气蔓延。如果粪渣无出路，会发生清掏者随意倾倒，粪渣的较终处置引起再次污染。
大部分化粪池很难做到定期清掏, 有的甚至十几年从不清掏, 等到粪便溢漏才清理。因此, 造成大部分化粪池沦为“过流池”, 粪便几乎不经任何处理就排入下水道。
经过化粪池的酸性发酵后，其出水呈酸性，酸性污水对城市下水道有腐蚀作用。
寄生虫卵一般集中在粪皮和粪渣中。所以粪管要放在寄生虫卵少的中间粪液里。过粪管应倾斜安装在两个隔墙上：一池至二池的过粪管下端位于一池的下三分之一处，上端距二池顶部约100mm从二个池塘到三个池塘的粪肥，输送管的下端位于二个池塘的下三分之一或中间一半处，上端距离三个池塘的顶部约100。粪便通过管和隔墙之间的水平角度应为60。
仪器检查化粪池是否有有毒气体。在没有气体的情况下，组织车辆泵送化粪池内的漂浮物，用污水泵泵送漂浮物，然后从化粪池排出水。
在二级处理中，用高压清洗车稀释沉积的粪便和污泥，释放化粪池底部隐藏的气体，排出化粪池中的污水，再次检测化粪池是否含有有毒气体。
修整后，目测井内无产品漂浮其上，出入口畅通，坚持污水不溢出地面要安排化粪池注意事项
(1)打开化粪池井盖后通风10 ~ 15分钟。当人们不在池内时，禁止在池旁焚烧、吸烟或接打电话，以防止沼气燃烧或爆炸。
(2)请勿在池中工作，以免中毒或溺水。如果必须去游泳池，必须戴防毒面具，穿化学防护服，并采取相关防护措施
(3)化粪池井盖打开后，工作人员不得离开现场。清洗后，方便地盖上井盖，防止行人掉入井内发生事故。专业清洗整理各类化粪池、污水井、隔油池、地下室污水池等。