建有洁净用房的食品工厂厂区内的建筑物的位置应满足食品的生产工艺的需要，划分生活区，生产区中应明确区分洁净生产区，一般生产区和非食品处理区。
生产过程中发生空气污染较严重的建筑，应建在厂区内常年多风向的下风侧。
相互有影响的生产工艺，不宜设在同一个建筑物内，当设在同一个建筑物内时，各自生产区域之间应有有效的隔断措施。生产发酵产品应具备发酵车间。
食品工业洁净用房应根据食品生产对除尘和无菌生产要求的高低分级。洁净用房应明确其中生产的关键区域，分别定级。
食品厂净化车间建筑围护和室内装饰应选用气密性好、受温湿度变化影响变形小的材料。洁净车间的墙面、天花板表面应平整、光滑、清洁，无裂缝、接缝紧密。无颗粒工业洁净车间的建筑围护和室内装饰应采用气密性好、在温度、湿度变化作用下变形小的材料。
热力：分为干热与湿热，主要是利用高温的致死作用，使微生物的蛋白质和核酸等重要生物高分子发生变性、破坏，而导致细胞死亡。
气体：常用的化学剂有环氧乙烷、气态过氧化氢、甲醛、臭氧（O3）等，本法适用于在气体中稳定的物品。