微生物实验室净化工程良好的通风是关键，必要时更应配备抽风机。接种、分离及鉴定等操作应在生物柜中进行，对结核杆菌等传染性极强的微生物学检验时必须在100％外临床微生物学实验室接触多种有害微生物，为了防止交叉污染，保护工作人员健康，实验室应至少划分成3个区。
污染物处理：操作区须备有缸，以处理沾有活菌的玻片等污染物品。检验剩余的标本及使用过的带菌平板、试管均须集中地点放置，经处理后再洗涤或丢弃。
无菌室应完全封闭，进出无菌室至少要经两道门，中间隔有缓冲间，无菌室与外间设置一个可开闭的窗口，用于传递器具。
无菌室仅用于培养基分装等无菌操作，不能进行有菌标本的操作。操作人员操作时应严格关门，并戴好专用的口罩、帽子。
无菌室内应有空气过滤装置，并安装空调。
洁净度等级
同等面积下，万级净化车间和十万级净化车间的工程造价肯定是不一样的，而且净化等级越高其工程造价也是越高的。
施工面积
这个因素大家都知道的了，面积越大工程造价肯定也越高，毕竟使用的材料也更多了；如果洁净度等级也高的话，那工程总造价就更高了，这里面是一环连着一环的。