运输过程中产生二次污染。吸粪车的滴洒泄漏使臭气蔓延。如果粪渣无出路，会发生清掏者随意倾倒，粪渣的较终处置引起再次污染。
大部分化粪池很难做到定期清掏, 有的甚至十几年从不清掏, 等到粪便溢漏才清理。因此, 造成大部分化粪池沦为“过流池”, 粪便几乎不经任何处理就排入下水道。
经过化粪池的酸性发酵后，其出水呈酸性，酸性污水对城市下水道有腐蚀作用。
厌氧过程产生恶臭气体，造成周围空气质量恶化，尤其在清掏过程中，恶臭气体可影响数百米远。而且容易滋生蚊蝇等，对健康和环境造成极大威胁。
一般三个池的比例应该是2: 1: 3。一个池应该储存20天，二个池应该储存10天，三个池应该储存30天。化粪池的有效深度为1000毫米，较多不小于900毫米，与化粪池的上部空间相比，池深约为1150毫米。
注意事项：
1.吸粪车噪音比较大，要避开居民休息时间。
2.吸粪时避免弄脏作业现场和路人的衣服。
3.揭开盖子后，要有专人看管，做完后盖上盖子。
4.化粪池中的气体有毒易燃，只有在放出大量气体后才能进行操作，周围不允许有明火。