长期大量施用化肥造成土壤病菌虫卵增多，若不及时处理会传播病菌，使地下水中氨态、硝态和可溶性有机态氮浓度增高，以及地表与地下水富营养化，造成环境质量恶化，甚至危及到生物的生存。因此，合理使用有机肥料，既可减轻环境污染，又可减少化肥投人，一举两得。,不断更新土壤有机质。有机肥料转化为土壤有机质约占土壤有机质年形成量的三分之二，可见要补充有机肥料才能不断更新土壤有机质。很显然，施用有机肥料提高土壤肥力非常重要。,作物从土壤中摄入的各种养分，可通过用于有机肥的途径送给土壤。在农业生产中，只有做到好养分均衡环节，因应用药有机肥和无机化肥使土壤肥力不断提升。