巨细胞病毒感染
豚鼠巨细胞病毒多引起豚鼠的隐性感染，其感染特征和致病机理与人的巨细胞病毒感染非常相似，因此常用作人的巨细胞病毒感染研究的动物模型。
诊断和预防：本病的诊断应依据组织学观察唾液腺导管细胞内的特异性的嗜酸性包涵体。也可利用豚鼠胚细胞进行病毒分离，进而血清学检查CMV抗原。本病的预防可利用CMV弱毒苗接种豚鼠，使之产生免疫力， 然后用剖腹产技术建立无CMV的洁净豚鼠群。进而依靠严格的饲养管理措施保持豚鼠的无CMV状态。还可投用抗生素，如：金霉素、土霉素、磺胺三甲氧苄氨嘧啶或泰乐菌素，连续用药14天。
在我国不仅在牧区可以发展黑豚养殖，农区也具备良好的饲养条件。农区丘陵岗地占有一定面积，沿海滩涂广阔，饲草资源丰富，特别是西部民族地区利用草地发展黑豚养殖尢为适宜。随着我国外贸事业的发展，国内人民生活水平的提高，发展黑豚的养殖生产有着不可估量的前景。
体内寄生虫
（1）豚鼠艾美尔球虫
该球虫是寄生于豚鼠的唯一的艾美尔球虫，易在幼鼠中流行。感染豚鼠出现腹泻，甚至死亡。剖检可见肠炎，肠出血，盲肠粘膜增厚，有斑状出血点和含有虫体的白斑。维生素C缺乏，长途运输等因素可诱发本病。
（2）治疗方法
地克珠利，广谱苯乙腈类抗球虫药，以每百公斤饲料混1/千地克珠利预混剂100克；氯苯胍，每百公斤饲料拌药15克。以上两种药物轮换，地克珠利使用7-8个月后，换氯苯胍用4-5个月。上述药物也可用于治疗，一般用预防剂量的2~3倍。在治疗豚鼠球虫病时，可用1/千地克珠利预混剂，每百公斤饲料加400-500克拌匀，撤出其它饲料和饲草，连续用药2-3天，待发病得到控制后改为正常预防量。
豚鼠繁殖率高，抗病力强，性成熟早，在出生1到3个月时，性周期短，一般为16天左右，属于晚成性动物，即母鼠怀孕期较长，为63（59～72）天，每年可产6胎，胚胎在母体发育完全，出生后即已完全长成，全身被毛，眼张开，耳竖立，并已具有恒齿，产后1小时即能站立行走，数小时能吃软饲料，2到3天后，即可在母鼠护理下一边吸吮母乳，一边吃青饲料或混合饲料，迅速发育生长。仔鼠35天性成熟，一对豚鼠一年可循环繁殖80对。它们的怀孕时间在啮齿动物中算是比较长的，大概是50到75天。