洁净室悬浮微生物法应采用离心式、狭逢式和针孔式等碰击式采样器，采样时间应根据空气中微生物浓度来决定，采样点数可与测定空气洁净度测点数相同。各种采样器应按仪器说明书规定的方法使用。沉降微生物法，应采用直径９０mm培养皿，在采样点上沉降３０mm后进行采样，培养皿最少采样数应符合表Ｂ.５.２的规定。
用培养皿沉降菌，用碰撞式采样器或过滤采样器测定游浮菌，还应遵守以下规定：
１、采样装置采样前的准备及采样后的处理，均应在设游高效空气过滤器排风的负压实验室进行操作，该实验室的温度应为２２±２℃；相对湿度为５０％±１０％；
２、采样仪器应消毒灭菌；
３、采样器选择应审核其精度和效率，并有合格证书；
４、采样装置的排气不应污染洁净室；
５、沉降皿个数及采样点、培养基及培养温度、培养时间应按有关规范的规定执行；
６、洁净室浮游菌采样器的采样率宜大于１００Ｌ／min；
７、碰撞培养基的空气速度应小于２０m/s。
风量罩罩体与风口尺寸相差较大时会造成较大的测量误差，所以需要用尺寸相近的罩体进行测量。根据待测风口的尺寸、面积，选择与风口的面积较接近的风量罩罩体，且罩体的长边长度不得超过风口的长边长度的3倍；风口的面积不应小于罩体边界面积的15%，选择合适的罩体后，打开测量仪表，检查仪表正常，使仪表的各项设定满足使用要求；确定罩体的摆放位置来罩住风口，风口宜位于罩体的中间位置；保证无漏风，观察仪表的显示值，待显示值趋于稳定后，读取风量值，当风口风量较大时，风量罩罩体和测量部分的节流对风口的阻力会增加造成风量下降较多，为了消除这部分的风口风量较少，需要进行背压补偿。依据读取的风量值，考虑是否需要进行背压补偿，当风量值≤1500m3/h时，无需进行背压补偿，所读风量值即为所测风口的风量值；当风量值>1500 m3/h时，使用背压补偿挡板进行背压补偿，读取仪表显示值即为所测的风口补偿后风量值。
我们进行无尘车间气流流型(单向流)的检测,明确无尘车间内的设备或设施对气流的影响,选择或改善气流流型使之产生最小的湍流(涡流)，增加无尘车间最大的自净能力或恢复率，缩短自净时间。在紊流洁净室中，风的输送和混合都是紊流方式进行的。为确保污染物被清楚，无尘车间的各个部分必须均实现良好的空气混合。
气流流形的检测应按以下步骤进行：
1：布置测点：1)垂直单向流无尘车间选择纵、横剖面各一个，以及距地面高度0.8m、1.5m的水平面各一个;水平单向流无尘车间选择纵剖面和工作区高度水平面各一个，以及距送、回风墙面0.5和房间中心处等3个横剖面，所有面上的测点间距均为0.2m~1m；2)乱流无尘车间选择通过代表性送风口中心的纵、横剖面和工作区高度的水平面各一个，剖面上的测点间距为0.2m~0.5m，水平面上测点间距为0.5m~1m。两个风口之间的中线上应有测点。
2：测定方法：用发烟器或悬挂单丝线的方法逐点观察和记录气流流向，并可用量角器量出角度，发烟源可用超声波雾化(0.5um~50um水雾)的去离子(DI)水、喷射方法生成的乙醇或二醇、固态二氧化碳(干冰)等，在高强度光源下示踪。在确保对人和物无伤害时可以四氯化钛(TiCl4)作示踪粒子。